Это обсуждалось уже много раз, рекомендую погуглить. В кратце:
X11 - морально устаревшая реализация графического интерфейса в *NIX системах. Раннее X-сервер выполнял весьма многое, но часть его функций тулкиты и DE делают сами, в итоге осталась куча костылей, которые и выпилить тяжело, и как работают хрен пойми. Для обладателей ноутбуков с гибридной графикой X-сервер это жопа, так как костыльная система типа Bumblebee (Optimus) это костыль, а не адекватная реализация. Многие так же жалуются на тиринг "из коробки", но на дворе 2016 год, почти 2017, "из коробки" система должна работать сама, и адекватно, в mesa весьма солидный "набор" для драйверов. Добавим ещё и проблемы с безопасностью, а именно то что долгое время X-сервер требовал наличие root'а для запуска. Wayland как раз и создавался с целью избавится от недостатков X-сервера, а так же для соответствия современным реалиям. И хотя сам протокол уже готов к использованию, современные DE только подходят к его полноценной реализации, т.к. переписать на него софт задача не "раз плюнуть".