Исходное сообщение
"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0" Отправлено opennews, 13-Окт-16 11:09
Состоялся (http://ugene.net/ru/news.html) релиз UGENE 1.25 (http://ugene.net/ru/), пакета для работы молекулярного биолога, предоставляющий  инструменты для множественного выравнивания нуклеотидных и аминокислотных последовательностей,  филогенетического анализа, редактирования и аннотирования нуклеотидных и белковых последовательностей,  поддержания биоинформационной базы данных, визуализации,  поиска геномных вариаций, работы с хроматограммами и многого другого (http://ugene.net/ru/key_features.html). Исходные тексты UGENE распространяются (http://ugene.unipro.ru/ru/download.html) под лицензией GPLv2, сборки доступны для Windows, macOS и Linux. В новом выпуске для NGS добавлена возможность фильтрации прочтений, не имеющих пары, при картировании парных прочтений на референсную последовательность (с помощью BWA, Bowtie2 и т.п.).  в В диалогах настройки схем анализа сырых данных NGS добавлен расширенный набор параметров для обрезания адаптерных последовательностей (5′-адаптеры, 3′-адаптеры, 5′- и 3′-адаптеры). В Assembly Browser выполнена оптимизация вычисления покрытия. Продолжается работа над новой функцией UGENE для удобной визуализации и анализа данных секвенирования по Сэнгеру. URL: http://ugene.net/ru/news.html Новость: http://www.opennet.ru/opennews/art.shtml?num=45314