The OpenNET Project / Index page

[ новости /+++ | форум | wiki | теги | ]

Программа с открытым кодом и wikipedia помогут расшифровать генотип человека

11.07.2008 01:58

Ученые из университета Сан Диего, Института Геномики исследовательского Фонда Novartis (Genomics Institute of the Novartis Research Foundation) и Школы медицины университета Вашингтона (Washington University School of Medicine), решили для ускорения расшифровки человеческого генома создать общедоступную базу данных, построенную по технологии Wikipedia и как часть энциклопедии wikipedia.org.

Чтобы создать начальную "критическую массу" информации, вокруг которой в дальнейшем смогут объединиться другие исследователи, планируют написать статьи-зародыши, призванные побудить исследователей к дальнейшему редактированию и уточнению данных.

Для ускорения процесса (создания базы данных), был разработан шаблон для wikipedia и программа на Java с открытым кодом (лицензия Apache License 2.0), которая берет информацию из базы данных Entrez Gene и создает по шаблону статьи с типом "статья не завершена" (stub), как например статья про ген ITK, в которых содержится список используемых в статье определений, внешних определений, альтернативных названий, функции гена (из проекта the Gene Ontology), расположение и ссылки на другую информацию об этом гене, как например ссылки на информацию о аналогичном гене мышей.

Как показал дальнейший анализ логов wikipedia, создание программой 7500 новых статей уже привело к 2-кратному увеличению активности по редактированию статей по генетике млекопитающих.



  1. Главная ссылка к новости (http://rss.slashdot.org/~r/Sla...)
  2. The Long Tail
Автор новости: zyx
Тип: К сведению
Короткая ссылка: https://opennet.ru/16908-wiki
Ключевые слова: wiki, opensource
Поддержать дальнейшую публикацию новостей на OpenNET.


Обсуждение (13) Ajax | 1 уровень | Линейный | +/- | Раскрыть всё | RSS
  • 1.3, winterheart (?), 10:57, 11/07/2008 [ответить] [﹢﹢﹢] [ · · · ]  
  • +/
    Чувствуется, что новость писалась человеком, далеком от Википедии.
    То, что здесь называется программой, по сути является ботом, который по вводным данным и шаблону заливает статьи в пространство Вики. Вообщем-то ничего нового и экстраординарного, это общеизвестная практика. И заливка не самая масштабная, бывали покрупнее. Да и ботов пруд пруди, и большая часть из них под открытой лицензией.
     
     
  • 2.6, Аноним (6), 15:14, 11/07/2008 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    Бот не программа чтоли?
     
  • 2.14, zyx (ok), 18:04, 11/07/2008 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    >Чувствуется, что новость писалась человеком, далеком от Википедии.
    >То, что здесь называется программой, по сути является ботом, который по вводным
    >данным и шаблону заливает статьи в пространство Вики. Вообщем-то ничего нового
    >и экстраординарного, это общеизвестная практика. И заливка не самая масштабная, бывали
    >покрупнее. Да и ботов пруд пруди, и большая часть из них
    >под открытой лицензией.

    Размер генома человека – 3 миллиарда пар нуклеотидов, или порядка 30 тысяч генов, из которых только о порядка 1500 достоверно известно что именно данные ген делает или что дефект данного гена приводит к какой-то болезни, а есть еще масса генов, которые явно работают в комбинации (то есть какие-то только в комбинации с определенными другими, какие-то один другой включает/выключает), так что лить и лить, разбираться и разбираться..

     

  • 1.4, Аноним (4), 11:21, 11/07/2008 [ответить] [﹢﹢﹢] [ · · · ]  
  • +/
    >по технологии Wikipedia

    Всмысле MediaWiki?

     
  • 1.5, Имя (?), 13:13, 11/07/2008 [ответить] [﹢﹢﹢] [ · · · ]  
  • +/
    надо скорее начинать клонировать людей-
    тогда и геном быстрее расшифруется.
     
  • 1.7, Аноним (6), 15:15, 11/07/2008 [ответить] [﹢﹢﹢] [ · · · ]  
  • +/
    Что-то каждый год новости выходят, что вот таконец то расшифровали генотип человека, и все че-то расшифровывают, расшифровывают...
     
     
  • 2.8, фуфик (?), 15:30, 11/07/2008 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    >Что-то каждый год новости выходят, что вот таконец то расшифровали генотип человека,
    >и все че-то расшифровывают, расшифровывают...

    Так вроде ж давно расшифровали. Или уже умудрились опять зашифровать?

     
     
  • 3.9, Aleksey (??), 15:52, 11/07/2008 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    До этого был проект предназначенный для разбиения генома человека на отдельные гены. Данная работа ставит целью описать структуру и назначение каждого гена.

    P.S. Надеюсь так вам станет понятнее.

     
     
  • 4.10, фуфик (?), 16:34, 11/07/2008 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    >До этого был проект предназначенный для разбиения генома человека на отдельные гены.
    >Данная работа ставит целью описать структуру и назначение каждого гена.
    >
    >P.S. Надеюсь так вам станет понятнее.

    Угу спс мну всё пнятно.

     
  • 3.11, Logo (ok), 16:47, 11/07/2008 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    Если сказать реальнее, то расшифровали только то, что стало ясно, что снова придется расшифровывать. До победы ой как далеко.......
     

  • 1.15, Аноним (4), 11:24, 12/07/2008 [ответить] [﹢﹢﹢] [ · · · ]  
  • +/
    Да вообще гены - пропиентарный софт, приходится reverse ingenering'ом заниматься :(
     
     
  • 2.17, Max (??), 10:09, 13/07/2008 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    >Да вообще гены - пропиентарный софт, приходится reverse ingenering'ом заниматься :(

    +5 :-)

     

  • 1.16, Аноним (6), 13:16, 12/07/2008 [ответить] [﹢﹢﹢] [ · · · ]  
  • +/
    Если бы еще эти программы помогли не делать "желтушных" заголовком и не допускать элементарных пунктуационных ошибок в них ...
     

     Добавить комментарий
    Имя:
    E-Mail:
    Текст:
    При перепечатке указание ссылки на opennet.ru обязательно



    Спонсоры:
    Inferno Solutions
    Hosting by Hoster.ru
    Хостинг:

    Закладки на сайте
    Проследить за страницей
    Created 1996-2021 by Maxim Chirkov
    Добавить, Поддержать, Вебмастеру