В статье "Securing MySQL: step-by-step" подробно разбираются шаги помогающие увеличить безопасность MySQL сервера, например, описано как запустить MySQL в chroot окружении.
Вообщем, я считаю, что это очень полезная работа для начинающих. Кто сможет лучше и красивей - пишите доки.