> Эм, по-моему бутсектор логического диска (не партишна) искал нечто типа IO.SYS

да ничего он не "искал", в нем за вычетом bpb места еще меньше чем в mbr, и того половина занята выводом юзерфрендли сообщения "not a dos disk, replace user and press anykey". (заметь, в груб даже такое не поместилось) Тупо сравнивал несколько байтиков по фиксированному адресу, а потом по другому адресу подряд несколько секторов читал. Поэтому байтики и секторы должны были находиться строго там, где он их рассчитывал увидеть.
Это только местный клоун может думать, что туда драйвер файловой системы мог поместиться.

grub и lilo заметь, попродвинутей будут - в них blocklist записан, а не гвоздем прибит. Правда, из-за этого уже даже на такое "юзерфрендли" не осталось места, гадай на первых буковках, почему оно вдруг повисло.

> MSDOS.SYS? А оно потом - командкома уже.

вот командцома оно уже честно читало как файл. Поскольку его уже полностью загрузившийся дос и читал уже штатными апи.