Исходное сообщение
"Недоработка в Python-скрипте могла привести к неверным резул..." Отправлено Scriptor, 14-Окт-19 18:17
Они считали хим.сдвиги во внешней квантовохимической программе (Gaussian) для разных конформеров (грубо говоря, результатов скручивания, изгиба и прочих искажений молекулы, обусловленных тепловыми колебаниями), а потом читали файлы текстовых выводов этой программы и обрабатывали (усредняли) их для определения средневзвешенного значения. "Published in 2014, this Nature Protocols manuscript provides detailed instructions aimed at enabling those with minimal theoretical knowledge of the subject area to calculate gauge-including atomic orbital (GIAO) NMR chemical shifts and includes Python scripts to streamline the process. . It has been cited over 130 times in the last 5 years. Detailed investigations traced the source of the discrepancies to those Python scripts that summarize the conformers, free energies, Boltzmann distributions, and isotopic tensors from the various Gaussian output files and then use this information to calculate Boltzmann averaged chemical shifts (step 15)".