> У него просто сильно пригорело и начал он писать всякую ересь. Причем
> тут установка пакетов При том что у пользователей BSD традиционно какие-то очень превратные представления о пакетных менеджерах и их удобстве и фичности. Если б этот кадр один такое писал - я бы еще понял. Но местные бсдшники вообще не могут осознать плюсы нормального пакетника. Почти все. Да что там, когда сдох сервер опеннета - реанимация сайта была больше недели, чтоли. С чуть ли не поиском такого же железа. Представляешь себе такой крындец с пингвинами? Даже ламероватый нуб за неделю просто загвоздит все вокруг линуксными серверами.
> когда я указал на нужное мне, но отсутствующее приложение в портах (graph-tool)?
Ну я не в курсе что это за приблуда и т.п. поэтому оставлю данный вид дебатов другим.
> Все верно, в Debian пакеты ставятся из stable и backports + репы
> с сайтов разработчиков. Например: Cran3 для R, graph-tool.skewed.de для graph-tool.
Ну да, а базы как таковой нет. Есть метапакеты для вкатывания каких-то типовых пресетов, но если пресеты не нравятся - ставишь так как нравится самому. Иногда зависимости конечно могут быть дурноваты, но тут уж у любой медали есть 2 стороны. Я для встройки запиливаю весьма лаконичные дебианы debootstrap'ом. И понятно на чем вертел бред с базовыми системами. Пакетник позволяет и быстро ворочать большие пресеты и обновлять все одним чихом и более гранулярно рулить, если надо.
> несколько версий какой то библиотеки, хотя использоваться будет последняя) Если с
> этим пытаться что то делать приобретешь много гемора...
В дебиане иногда тоже может потребоваться попилотировать пакетник нестандартно. Но это редко и для разборчивых юзерей и сильно нестандартных задач (типа жесткой минимизации размера образа под эмбед или контейнеры).