Вариант для распечатки		Пред. тема | След. тема
Форум Разговоры, обсуждение новостей
Режим отображения отдельной подветви беседы		[ Отслеживать ]

Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.24, opennews (ok), 25-Авг-16, (0) [смотреть все] Вот в таких программах для меня было бы болевым шоком услышать,что в ПО найдена , odity (ok), 15:54 , 25-Авг-16, (1) –1 // Экая вы дамочка мнительная - Ошибки там есть, 100 Как и в ПО самолётов к при, _ (??), 16:09 , 25-Авг-16, (2) +3 У тебя в ДНК тоже есть ошибки , anonymous (??), 18:02 , 25-Авг-16, (3) +4 // Это не ошибки , rob pike (?), 07:47 , 26-Авг-16, (16) +1   // клоун и зачем было это писать Ты прав, ошибки есть и они необходимы ДНК - это п, Аноним (-), 22:22 , 27-Авг-16, (20) –1   клоун исследования последних лет показывают, что ДНК также может хранить операт, Аноним (-), 22:34 , 27-Авг-16, (21) –1   клоун в биохимии различают несколько видов связей 1 жёсткие - это связи в моле, Аноним (-), 23:31 , 27-Авг-16, (23)   Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.24, rob pike (?), 07:11 , 26-Авг-16, (13) // Какого рода конвертация была Флоат2инт что ли Целочисленное переполнение , АнонимХ (ok), 11:51 , 26-Авг-16, (17) // Вы не о том спрашиваете Задайтесь лучше вот каким вопросом - если только ошибок, rob pike (?), 11:59 , 26-Авг-16, (18) –1 Да, смысл понятен сразу был, после первого твоего сообщения, АнонимХ (ok), 14:27 , 26-Авг-16, (19) Если они просканируют bash-скрипты статическим анализатором, то обнаружат что ок, Аноним (-), 08:33 , 28-Авг-16, (24) Наконец-то стали появляться нормальные дизассемблеры для ДНК , Аноним (-), 18:10 , 25-Авг-16, (4) // Успехи немного преувеличены , rob pike (?), 07:16 , 26-Авг-16, (14) // Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.24, rob pike (?), 07:22 , 26-Авг-16, (15) // клоун ген по определению - это последовательность ДНК, дающая организму определ, Аноним (-), 22:48 , 27-Авг-16, (22) Благодарю за информацию Буду рекомендовать посмотреть, студиозусы, местами, - , ZloySergant (ok), 00:34 , 26-Авг-16, (5) +1 1,4,5

Сообщения

[Сортировка по времени | RSS]

	16. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.24"	+1 +/–
	Сообщение от rob pike (?), 26-Авг-16, 07:47
	Это не ошибки. > в руки попалась статья двухмесячной давности, где японцы рассказывают как им удалось переназначить СТОП-кодон (UAG) кишечной палочки одной из аминокислот, и при этом сделать всего лишь неколько генетических модификаций во избежание летального исхода! Свой абстракт они заключают так: "Результат обнаруживает неожиданную гибкость генетического кода". > СТОП-кодоны узнаются не молекулами тРНК, как обычные кодоны, а специальными белками, называемыми факторами терминации (release factors). Они запускают цепь реакций, в итоге которых рибосома освобождается от мРНК. Если эти белки по какой-то причине отсутствуют в клетке, рибосома "зависает" на СТОП-кодонах и производство белков останавливается. > Японцы нокаутировали ген, кодирующий фактор терминации RF-1. Он узнает один из стоп-кодонов, а именно UAG. Зато они ввели глутаминовую тРНК с антикодоном для UAG. Это значит, что те гены, которые заканчиваются на UAG, будут транслироваться дальше, до тех пор пока в той же рамке считывания не встретится другой стоп-кодон - UAA или UGA. > Но перед этим они уточнили из других источников, какие из генов E.coli являются ключевыми, т.е. такими, нокаут одного из которых ведет к гибели клетки. Таких генов в геноме палочки менее 10%. Это вовсе не значит, что бактерия будет жить, если остальные 90% генов выключить. Это значит, что если хотя бы один из этих 10% выключен - клетка умирает. > Среди ключевых генов нашлось всего семь штук, которые заканчиваются UAG-кодоном. Остальные заканчиваются другими СТОП-кодонами (UAA или UGA). Японцы методом исключения выяснили, что из этих семи генов только одному необходимо заменить UAG кодон на UAA, чтобы он терминировался правильно. Остальные 6 белков вполне себе переживают тот факт, что у них есть ненужный хвост. Что уж говорить про неключевые гены. > Правда, оказывается, что у E.coli почти половина генов, заканчивающихся на UAG, имеют еще и запасной СТОП-кодон (UAA или UGA) в пределах всего десяти триплетов от конца гена и в той же рамке считывания. Поэтому в этих белках лишний хвост был совсем маленький, примерно из десяти аминокислот. Но есть гены, у которых запасного СТОП-кодона нет и первый попавшийся случайно UAA- или UGA-кодон может оказаться далеко. И ничего - все работает!
	Ответить | Правка | Наверх | Cообщить модератору

	20. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.24"	–1 +/–
	Сообщение от Аноним (-), 27-Авг-16, 22:22
	клоун: и зачем было это писать? Ты прав, ошибки есть и они необходимы. ДНК - это программа, по которой белки-строители собирают другие белки, создавая клетку. ДНК каждой клетки описывает весь организм. На всякий случай она продублирована (не у всех, у простейших она одна, а у бобовых по хитрому закольцована), что позволяет избегать ошибок. Белки-строители разбирают ДНК, проверяют что обе цепи совпадают (если нет, то запускается механизм самоуничтожения клетки), делают копию участка ДНК (= РНК, мРНК), собирают ДНК заново. Затем по РНК собирают белки. Собирают наплевательски, зато быстро. Вторая группа белков проверяет, что сборка прошла успешно. Если допущена ошибка - белок отбраковывается и разрушается. В брак попадает до 30% всех собранных белков. В случае острого стресса или дефицита пищи отбраковка не выполняется. Программа ДНК состоит из: 1. указания какая аминокислота (из них состоят белки) нужна. 2. переходов GOTO 3. признака конца последовательности Наибольший интерес представляют переходы, их количество может достигать 80% всей информации в ДНК. ДНК хранит информацию обо всех накопленных возможностях. Т.е. ДНК человека хранит информацию о жабрах (рыбы) и хлорофилах (растения). Типа когда-нибудь пригодится. Именно переходы и отбраковка являются движущей силой эволюции: даже самые небольшие изменения могут привести к серьёзным последствиям. ДНК всех немножко отличается, но это не имеет значения, пока не возникнет серьёзная угроза. Пример 1: малярия убивает. Серпоклеточная анемия (СА) - генетическое заболевание, при котором кровь переносит меньше кислорода; больные СА не болеют малярией. В центральной Африке очень многие больны СА. Тысячелетиями это было важно для выживания. С 4 тысячелетия до н.э. это позволяло избежать попадания в рабство (рабовладельцы не хотели заболеть малярией, поэтому избегали этих районов). Пример 2: химический завод отравляет реку, в реке умирают карпы (отравление), за карпами умирают щуки (голод). Спустя 10 лет появляются карпы, устойчивые к химикатам. Ирония в том, что они накапливают химикаты, поэтому ни щуки, ни люди есть их не могут. Из-за этого карпы сильно расплодились, полностью восстановив популяцию, но они медленнее плавают, что не позволяет им выйти за пределы заражённой воды.
	Ответить | Правка | Наверх | Cообщить модератору

	21. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.24"	–1 +/–
	Сообщение от Аноним (-), 27-Авг-16, 22:34
	клоун: исследования последних лет показывают, что ДНК также может хранить оперативную информацию. Папу-мышь помещали в камеру где после запаха одеколона следовал болезненный удар током, выработав условный рефлекс. У него взяли сперму и с помощью ЭКО оплодотворили маму-мышь. У детей сохранился папин рефлекс, хотя у мамы его нет и ни мама, ни дети никогда не встречали папу и не нюхали одеколон. Яйцеклетки женщин создаются во время рождения и больше не изменяются. Сперматозоиды мужчин создаются в течении всей жизни. Раньше считалось, что это нужно для массового оплодотворения, типа даже один мужик может покрыть сотни тысяч самок (природа сильно избыточна когда речь идёт о продолжении рода), но этот опыт показывает, что есть и другие причины. Что более интересно, раз ДНК может передавать информацию, интересны границы этой возможности. Зачем учить человека, если можно заложить это в гены?
	Ответить | Правка | К родителю #16 | Наверх | Cообщить модератору

	23. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.24"	+/–
	Сообщение от Аноним (-), 27-Авг-16, 23:31
	клоун: в биохимии различают несколько видов связей: 1. жёсткие - это связи в молекулах веществ, напр. вода H2O 2. слабые - это связи, которые возникают если вещества находятся рядом. Их легко создать и легко разорвать, но сами они не разорвутся. Так напр. молекула аденозина может "притянуть" 1 или 2 молекулы фосфорной кислоты. Т.о. получится АДФ или АТФ. аденозин + энергия + фосфорная кислота = АДФ + вода. АДФ + энергия + фосфорная кислота = АТФ + вода. Формулы обратимы. АДФ и АТФ являются "энергией" клетки. 3. очень слабые связи. Возьмём белок, состоящий из 20 аминокислот: 0123456789АБВГДЕЁЖЗИ Между 3 и Ё возникнет слабая связь, добавим энергию и молекула свернётся. После этого 0А и 39 образуют очень слабые связи, что приведёт ещё к одному сворачиванию. После этого 4ГЖ (3 аминокислоты) с помощью очень слабой связи смогут соединиться с молекулой кислорода. Бинго! Теперь мы можем переносить кислород (дыхание). Полученный белок имеет сложную трёхмерную структуру и "работает" только в ней. Можно заметить, что не все основания используются. Неиспользуемые можно заменять на что угодно. Можно (в разумных пределах) увеличивать и уменьшать размеры неиспользуемых последовательностей аминокислот. Это позволяет избежать ситуации, когда небольшие изменения в ДНК моментально убивают организм. У вирусов это позволяет "срастить" два белка, дав им одинаковое начало или конец с помощью переходов и т.о. уменьшить размер ДНК. PS: в своё время я сильно увлекался биохимией и узнал очень многое о том, что такое жизнь и как работает организм на молекулярном уровне. А также то, как организованы насекомые (их органы чувств, датчики сгиба лапки, и т.п.), что сегодня помогает мне в моих занятиях робототехникой.
	Ответить | Правка | К родителю #16 | Наверх | Cообщить модератору

Архив | Удалить

Рекомендовать для помещения в FAQ | Индекс форумов | Темы | Пред. тема | След. тема