Если Вы хотите установить Internet Explorer автоматически используйте  IEs4linux. 
Это руководство для тех пользователей которые не хотят использовать IEs4linux. 

1.Создаем новую конфигурацию wine в другой директории с помощью wineprefix. 

   wineprefixcreate --prefix ~/.wineIE6 

2. Следующим шагом установим в переменной путь к каталогу  для IE6, выполняем 

   export WINEPREFIX="$HOME/.wineIE6"

3.Необходимо удалит или переместить следующие файлы, иначе wine не даст при
установке IE обновить эти файлы

   Program Files/Internet Explorer/iexplore.exe 

в каталоге ~/.wineIE6/windows/system32 

   mshtml.dll
   shdoclc.dll
   shdocvw.dll
   shlwapi.dll 
   urlmon.dll
   wininet.dll 

4.Запускаем winecfg, переходим на закладку Библиотеки(Libraries ) и добавляем
следующее приложение и библиотеки:

   iexplore.exe 
   mshtml 
   shdoclc 
   shdocvw 
   shlwapi 
   urlmon 
   wininet 
   mlang 

И устанавливаем их в Сторонняя, встроенная (native, builtin.) 

5.Устанавливаем версию эмуляции 2000 в winecfg. 

6.В реестре надо указать версию IE ниже чем 6.  

7. HKEY_LOCAL_MACHINE->Software->Microsoft->Internet Explorer->Version Например 5.0. 

8.Запускаем IE6SETUP.EXE. Он должен установиться без ошибок. 
(можно использовать параметр  /q чтобы он не задавал вопросов при инсталляции) 

9.Теперь нужно зарегистрировать все библиотеки (dll) в каталоге  ~/.wineIE6/windows/system32 .
Открываем любую консоль переходим в каталог и выполняем команду  дважды: 

   for i in *.dll *.ocx; do regsvr32 /i $i; done

10.С этого момента IE6 будет запускаться  но не будет ничего  отображать. 
Чтобы исправить эту проблему надо скачать файл msls31.dll
(используйте google) и поместить его в ~/.wineIE6/windows/system32.    
Можно взять с машины с Windows.

11.Теперь Вы можете запускать IE6.

   WINEPREFIX="$HOME/.wineIE6" wine iexplore.exe


Первоисточник текста на английском: http://appdb.winehq.org/appview.php?versionId=469
Автор: Artem Tashkinov, перевод: Spike.