В статье "Live Backups of MySQL Using Replication", для создания горячего бэкапа MySQL базы, предлагается реплицировать данные на запасной MySQL сервер, на котором производить бэкап данных в обычном режиме, прекратив на время прием реплик.

Кроме того, вторичный сервер можно использовать для балансировки нагрузки и в качестве временной замены при крахе основной системы.